第四季的剧情接着第三季结束的地方继续，囚犯们在集体越狱后在附近的湖里戏水 ，亚历克斯在温室里面对一个来势汹汹的狱警……在新的工作人员和囚犯安顿下来后，卡普托发现他担任监狱长的新角色遇到了困难。 原有的囚犯被召集回营地，一旦所有人都被抓起来，大批新的囚犯涌入会让每个人都头疼。